2003年11月，教育部制定了《关于对全国592所普通高校进行本科教学水平评估的通知》，确定了我校为教育部本科教学工作水平评估单位。
　　在取得哈校区建设办学空间扩大、学科建设办学层次提升形势下，全校进入迎评促建的工作热潮之中。通过建立机制、全员动员、周密部署、狠抓整改，历经三年时间，以评促建、充实内涵、转型发展，教学管理更加科学规范，师资队伍建设明显加强，办学实力明显提升，办学质量和办学效益显著提升。
2007年9月16日至21日，国家教育部本科教学工作水平评估专家组一行13人入校，对我校本科教学工作进行全面考察。2008年教育部授予学校教育教学水平质量 “优秀”单位。2008年9月8日上午，我校在科技广场召开了教学评建表彰暨庆祝教师节大会。省政府奖励学校人民币100万元。
学校围绕学生全面发展、成人成才需求、经济社会发展需求这一主线，结合学校办学定位和应用型人才培养目标定位，在实践中凝炼出“大德育、大工程、大实践”的“三大”教育理念，构建了以“大德育”为先导、“大工程”为背景、“大实践”为途径的应用型人才培养体系。
2005年，学校建成了瓦斯等烃气输运管网安全基础研究国家级专业中心实验室。
　　2005年，学校从美国、德国等国家引进一批具有世界先进水平的设备，建设了现代制造工程中心。
　　2006年，学校建成了工程训练与基础实验中心。
发 展 创 造 机遇、机遇赢得发展，坚持发展硬道理，学校取得了本科教学工作水平评估优秀、哈校区建成等成绩，为更名大学创造了前提条件。
　　更名大学，是学校历史发展“天道酬勤”之硕果，是一以贯之传承着“自强不息、创业创新”的学校精神，不断开拓进取的诠释。
2013年1月18日，全国高校设置评议委员会六届二次会议通过学校更名大学事宜。4月18日教育部正式下发批准学校更名为黑龙江科技大学的文件。
　　4月28日学校举行了 “更名大学”升旗仪式。更名大学实现了几代科大人的夙愿，谱写了学校发展史上具有划时代意义的辉煌篇章，进一步凝聚了人心，鼓舞了斗志，扩大了影响，为我校开启百年名校新征程注入了强大动力和活力。
2013年4月28日，时任党委书记宋有、校长赵国刚为更名大学揭牌。
2012年，学校获得“煤矿事故应急救援与影响控制”服务国家特殊需求博士人才培养项目。2014年“服务国家特殊需求博士人才培养项目建设工作交流会”在我校召开。
2012年，学校被教育部授予“全国毕业生就业典型经验高校”。